據日本時事通訊社24日報導，因為有害大米事件影響擴大，日本大阪，福岡，熊本三地警方組成聯合搜查小組，對三笠食品總部及相關的28個公司企業進行徹底搜查，這些企業涉嫌違反了日本食品衛生法和不正當當競爭防止法。
約50名員警參加了搜查任務，三笠食品載日本福岡縣的工廠遭到了徹底搜查。同時，三地警方組成了聯合調查總部。警方稱，因為有毒大米事件從根本上對食品安全造成的惡劣影響，三笠食品事件可能超出一般民事案件的範疇，會上升至刑事案件。
根據調查，從2007年11月到今年1月，三笠食品和集團下屬公司辰之巳進口了110噸工業大米，再包裝成食用米轉賣給零售企業，經大阪府警方檢測，這些大米含有高度致癌性曲黴菌和高於基準值量杯的甲胺磷農藥。
三笠食品還從越南進口了5.4噸大米，標注成國產米進行倒賣。2003年至今，三笠食品共從日本政府買進了800噸工業大米，分包成食用米出售。9月初，有毒大米事件曝光，流通範圍涉及近400家企業，其中部分是學校，養老院和醫院，19日日本農林水產省大臣引咎辭職。